PPBIOTEC - Programa de Pós-graduação em Biotecnologia
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Item Identificação de proteínas exclusivas de fitopatógenos da família Xanthomonadaceae : uso de genômica comparativa para identificação de novos alvos de combate.(2016) Assis, Renata de Almeida Barbosa; Moreira, Leandro Marcio; Guttman, David S.; Moreira, Leandro Marcio; Garcia, Camila Carrião Machado; Laia, Marcelo Luiz deA família Xanthomonadaceae compreende espécies diferentes de proteobactérias não patogênicas e patogênicas que infectam diferentes hospedeiros, incluindo humanos e plantas. Nesse estudo, foi realizado uma análise comparativa usando o genoma completo de 69 cepas bacterianas pertencentes à família Xanthomonadaceae com foco na identificação de famílias de proteínas exclusivas de fitopatógenos que poderiam justificar o estilo de vida e a capacidade desses microrganismos infectarem hospedeiros compatíveis. Foram identificadas sete famílias de proteínas fitopatógeno-específicas, todas supostamente secretadas pelo sistema secretório tipo II: PheA (CMs), LipA/LesA, VirK, e quatro famílias de proteínas envolvidas na degradação de N-glicanos, NixE, NixF, NixL e FucA1. Análises filogenéticas e in silico dessas famílias de proteínas revelaram que todas elas possuem ortólogos em outras bactérias simbióticas ou patogênicas de plantas e estão envolvidas na modulação e evasão do sistema imune. Uma vez que esse estudo inclui microrganismos estreitamente relacionados, com estilos de vida diferenciados e evidencia proteínas diretamente relacionadas com adaptação dentro dos tecidos vegetais, abordagens inovadoras podem ser implementadas visando não somente a utilização destas proteínas como alvos biotecnológicos para o controle da doença, mas também contribuindo para a nossa compreensão da coevolução de bactérias associadas a plantas.