Navegando por Autor "Mota, Ester Alves"
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Item Caracterização de fungos filamentosos com potencial para biorremediação de águas contaminadas com manganês.(2015) Mota, Ester Alves; Cota, Renata Guerra de Sá; Chinalia, Fábio Alexandre; Rosa, Luiz HenriqueDevido à alta estabilidade do íon manganês (Mn2+) em solução aquosa, existe uma grande dificuldade para removê-lo de águas contaminadas. Uma das formas de remover o Mn2+ é a utilização de microrganismos que podem oxidar o íon Mn2+. Fungos podem remover o Mn2+ por vários mecanismos dentre eles a oxidação mediada por lacase e adsorção. Esse trabalho teve como objetivo isolar fungos a partir de água de drenagem de mineração de Mn e testar a capacidade de biorremoção do íon Mn2+ de cinco isolados (7,18,23,26 e 31). Os fungos foram isolados utilizando Agar batata, mineral e Sabouraud. Os ensaios de biorremoção do Mn2+ pelos isolados foram realizados utilizando-se caldo Sabouraud contendo 140 e 50 mgL-1 do íon Mn2+. O decaimento da concentração de Mn2+ solúvel foi medido por espectrometria de emissão atômica com fonte plasma. Foram realizados ensaios de biorredução usando bióxido de manganês nas mesmas condições. Os fungos foram cultivados em meio suplementado com 2,2'-azino-bis-(3-etilbenzotiazolina-6- ácido sulfônico) para testar a produção de lacases extracelulares. A morfologia foi detectada por microscopia eletrônica de varredura e a composição de metais nas hifas por adsorção, foi caracterizada por EDS. A identificação dos isolados foi realizada utilizando análise filogenética da região do rRNA do 18S e ITS. Foi feito teste com N.N'-Dimetilamino-p,p'- trifenilmetano-o"- ácido sulfônico para detecção de Mn3+ /Mn4+ extracelular. O teste de presença de lacases foi positivo para os isolados 18, 23 e 31. Observou-se uma remoção de Mn2+ de 86,07% e 96% para o isolado 31 em 140 e 50 mgL-1 do íon Mn2+, respectivamente, sem ocorrer redução no ensaio com MnO2. A filogenia sugere que o isolado 7 pertence ao gênero Hypocrea; o isolado 18, Penicillium; o isolado 26, Aspergillus e o isolado 31, Cladosporium. As análises de microscopia eletrônica de varredura corroboram os resultados moleculares. A EDS mostrou que o Mn2+ removido está adsorvido nas hifas apenas de Cladosporium. Hypocrea foi capaz de oxidar Mn2+ a Mn3+ /Mn4+ no meio de cultura. Em conjunto os resultados demonstram que o isolado pertencente ao gênero Cladosporium é o mais eficiente na biorremoção de Mn2+, utilizando o mecanismo de adsorção associado à secreção de lacase extracelular. Novos experimentos serão feitos para verificar se a presença de lacases contribui para a biorremoção ou se a taxa de biorremoção observada é ocasionada somente pela adsorção.Item Detection of Schistosoma mansoni long non-coding RNAs in the infected C57BL/6 mouse liver.(2021) Mota, Ester Alves; Oliveira, Victor Fernandes de; Patrocínio, Andressa Barban do; Rodrigues, Vanderlei; Cota, Renata Guerra de SáLong non-coding RNAs (lncRNAs) perform several types of regulatory functions and have been recently explored in the genus Schistosoma. Although sequencing and bioinformatics approaches have demonstrated the presence of hundreds of lncRNAs and microRNAs (miRNAs) in this genus, information regarding their abundance, characteristics, and potential functions linked to Schistosoma mansoni biology and parasite-host interaction is limited. Our objectives in the present study were to verify whether 15 previously identified S. mansoni lncRNAs are detectable in the host liver. In addition, we assess whether these lncRNAs are present in the S. mansoni infective form and the stages inside the definitive host. The detection of these 15 S. mansoni lncRNAs and a long terminal repeat (LTR) retrotransposon Saci 4 was performed in the eggs, cercariae, and 3.5-h schistosomula. All lncRNAs were found to be expressed in these stages; some of the lncRNAs were found in the livers of the infected C57BL/6 mice. In conclusion, S. mansoni lncRNAs were detected in host livers and quantified. Furthermore, many of the lncRNAs analyzed showed differential expression in the larval stages, indicating that they play a stage-specific regulatory role.Item Epigenetic markers associated with schistosomiasis.(2021) Assenço, Regina Aparecida Gomes; Mota, Ester Alves; Oliveira, Victor Fernandes de; Borges, William de Castro; Cota, Renata Guerra de SáIt is important to consider the use of the epigenome as source of complementary data for genome knowledge, which is suitable for the diagnosis of schistosomiasis. Usually, a laboratory diagnosis of schistosomiasis is performed by means of 1. Egg detection in the stool or urine by microscopy remains with limited sensitivity; 2. Immunological screening, in which positivity persists after treatment, and 3. Molecular appraisals prevail over the disadvantages of the currently used methods. In this sense, molecular methodologies are being developed based on epigenetic biomarkers, aiming to improve the diagnosis of the disease and clinical treatment as early as possible to prevent the occurrence of serious liver damage.Item Identification of 170 new long noncoding RNAs in Schistosoma mansoni.(2018) Oliveira, Victor Fernandes de; Moraes, Lauro Ângelo Gonçalves de; Mota, Ester Alves; Passos, Liana Konovaloff Jannotti; Coelho, Paulo Marcos Zech; Mattos, Ana Carolina Alves de; Couto, Flávia Fernanda Búbula; Caffrey, Brian E.; Marsico, Annalisa; Cota, Renata Guerra de SáLong noncoding RNAs (lncRNAs) are transcripts generally longer than 200 nucleotides with no or poor protein coding potential, and most of their functions are also poorly characterized. Recently, an increasing number of studies have shown that lncRNAs can be involved in various critical biological processes such as organism development or cancer progression. Little, however, is known about their effects in helminths parasites, such as Schistosoma mansoni. Here, we present a computational pipeline to identify and characterize lncRNAs from RNA-seq data with high confidence from S. mansoni adult worms. Through the utilization of different criteria such as genome localization, exon number, gene length, and stability, we identified 170 new putative lncRNAs. All novel S. mansoni lncRNAs have no conserved synteny including human and mouse. These closest protein coding genes were enriched in 10 significant Gene Ontology terms related to metabolism, transport, and biosynthesis. Fifteen putative lncRNAs showed differential expression, and three displayed sex-specific differential expressions in praziquantel sensitive and resistant adult worm couples. Together, our method can predict a set of novel lncRNAs from the RNA-seq data. Some lncRNAs are shown to be differentially expressed suggesting that those novel lncRNAs can be given high priority in further functional studies focused on praziquantel resistance.Item Manganese (II) removal from aqueous solutions by Cladosporium halotolerans and Hypocrea jecorina.(2020) Mota, Ester Alves; Felestrino, Érica Barbosa; Leão, Versiane Albis; Cota, Renata Guerra de SáManganese (Mn) is toxic at higher concentrations requiring its removal before returning the wastewater to the environment. This article reported the Mn removal of two fungi strains isolated from mine wastewater. ITS rRNA region sequencing identified the fungi strains as Cladosporium halotolerans and Hypocrea jecorina. Mn2+ removal assays were performed in Sabouraud broth with 50 mg L1 Mn2+ supplemented and bioleaching assays using MnO2 instead of MnSO4 at the same conditions. C. halotolerans removed 96 % of 50 mg L1 Mn2+ at two weeks without MnO2 bioleaching with 649.9 mg of biomass and H. jecorina removed about 50 % of Mn2+ in 21 days from initial 50 mg of Mn2+ L-1 with 316.8 mg of biomass. Extracellular laccases were present in C. halotolerans agar regardless of the Mn addition. Mn adsorbed was detected on C. halotolerans hyphae. Mn oxidation was positive to H. jecorina by reaction of its medium with Leucoberbelin blue.Item Parâmetros epigenéticos e parasitológicos associados à esquistossomose mansônica em camundongos C57BL/6 EBi3-/-.(2020) Mota, Ester Alves; Cota, Renata Guerra de Sá; Cota, Renata Guerra de Sá; Babá, Élio Hideo; Cabral, Fernanda Janku; Andrade, Milton Hércules Guerra de; Soares, Rodrigo Dian de Oliveira AguiarA hipótese desse trabalho é que o parasito Schistosoma mansoni em resposta ao sistema imune do hospedeiro mamífero altera seu estado epigenético e modula o estado epigenético do hospedeiro definitivo, e consequentemente a extensão do granuloma hepático. Para investigar essa hipótese foi utilizada a infecção em modelo murino C57BL/6 EBi3-/- e delineados os objetivos específicos: (i) a investigação dos efeitos parasitológicos; (ii) se o parasito modularia mecanismos epigenéticos no hospedeiro; (iii) se o hospedeiro poderia afetar a expressão de genes relacionados a mecanismos epigenéticos do parasito; (iv) avaliar a expressão de miRNAs e lncRNAs de S. mansoni no modelo C57BL/6 EBi3-/- bem como o potencial desses ncRNAs como biomarcadores (v) avaliar a expressão de genes relacionados a epigenética na cepa LE do S. mansoni resistente ao praziquantel (LE-PZQ). Foram utilizados camundongos C57BL/6 WTC (selvagem controle), WTI (selvagem infectado), EBi3-/-C (nocaute controle) e EBi3-/- I ( nocaute infectado) todos com 55 dias de infecção, 100 cercárias. Nos experimentos com S. mansoni, foram utilizados pool de parasitos recuperados de camundongos WT (LE-controle), cepa LE-PZQ e recuperados de EBi3-/- (LE de EBi3-/- ). Os resultados mostram que a esquistossomose murina no modelo C57BL/6 EBi3-/- I apresenta uma diminuição no dano hepático, no volume e número dos granulomas e quantidade de ovos nas fezes em relação ao observado no grupo WTI, (p<0,05) A demetilação do DNA está mais ativa que a metilação em todos os grupos devido ao maior nível de expressão das TETs em comparação com a expressão das DNMTs, sendo que, quanto maior o número de granulomas, menor a expressão de TET3 e DNMT1 em EBi3-/- I (p<0,05) A infecção por S. mansoni induz uma diminuição no conteúdo de metilação global do DNA. Os vermes adultos machos, recuperados do modelo C57BL/6 EBi3-/- apresentaram uma diminuição no conteúdo de metilação global do DNA comparando com o macho controle, bem como diminuição na expressão de SmUSPs 7, 22, 46 e 49, o que pode afetar o turnover da via ubiquitinaproteassoma e alterar o padrão de ubiquitinação nas histonas. Já na cepa LE-PZQ o SmUSP15 foi o único gene up regulado em machos. Verificamos também que os miRNAs 190 e 125A possuem função sexo-específica em S. mansoni, o miR-190-3p foi o único encontrado no plasma de C57BL/6 EBi3-/- I. Os lncRNA5 6 e 7 foram detectados no plasma de C57BL/6 EBi3-/- . Os dados indicam uma modulação epigenética do hospedeiro mamífero no parasito e abrem perspectivas para a influência epigenética na interação parasito-hospedeiro.